وقد تعرض المعتقلون لشتى أنواع التعذيب والمعاملة المهينة بقيادة النقيب عمرو المفتي المعروف بساديته، حيث تم تجريدهم من ملابسهم وجلدهم وصعقهم بالكهرباء في مناطق حساسة في أجسامهم وإغراقهم في الماء البارد بالإضافة إلى العطش والجوع. وكانت جلسات التعذيب هذه تستمر ست ساعات يوميا بغرض انتزاع اعترافات لتستعمل ضدهم.

ورغم تقديمهم لشكاوى بعد إطلاق سراحهم إلا أن النيابة العامة رفضت فحصهم من قبل الطبيب الشرعي لإثبات واقعة التعذيب الذي ستختفي آثاره.